2026년도 국립식량과학원 실험분석 연간 단가계약(6)

1. 사업 개요

• 목적: 2026 년도 국립식량과학원(농촌진흥청)에서 수행하는 작물 실험·분석에 필요한 밀(Wheat) 고밀도(HD) 유전자형 분석 서비스를 연간 단가 계약으로 제공받는다.
• 범위: 96 샘플을 한 묶음(“SET 2”)으로 구성한 고밀도서열·SNP‑array 분석을 수행하며, 연간 계약량(예: 6 건) 내에서 각 건마다 동일한 단위가격·품질 기준을 적용한다.
• 특징: 분석 전 과정(DNA 추출 → 라이브러리 제작 → 시퀀싱 → 데이터 처리 → 보고서 제공)을 일괄 수행하고, 분석 결과는 표준 포맷(VCF, raw‑seq 파일)과 요약 보고서 형태로 제공한다.

2. 주요 자격요건

• 사업자 요건
  • 국내·외 법인 등록 및 영업허가(사업자등록증) 보유
  • 최근 3 년 이상 분자생물학·고밀도 유전자형 분석 수행 실적
  • ISO 9001·ISO 14001(또는 동등한 품질·환경 관리 인증) 보유
• 인력·설비 요건
  • DNA 추출·라이브러리 제작·시퀀싱·데이터 분석 전 과정을 담당할 전문 인력(분자생물학자, 바이오인포매틱스 엔지니어 등) 2 명 이상 확보
  • 고밀도서열 분석용 시퀀싱 플랫폼(Illumina NovaSeq, HiSeq 등) 및 전용 시퀀싱·분석 서버(HPC) 보유
  • 샘플 보관·운송을 위한 생물안전·품질 관리 체계(Biosafety Level 2 이상) 구축
• 보안·데이터 관리
  • 연구 데이터·샘플에 대한 비밀 유지 계약(NDA) 체결 능력
  • 데이터 전송·보관 시 암호화·접근 제어 등 정보보호 조치 이행 가능

3. 핵심 기술/물품 요구사항

• 분석 대상: 밀(Wheat) 샘플 96 개 / SET 2 (연간 계약량은 6 건 정도)
• 분석 방법
  • 고밀도 유전자형 분석(HD‑Genotyping) – SNP‑array 또는 GBS(Genotyping‑by‑Sequencing) 방식
  • DNA 추출 → 라이브러리 제작 → 시퀀싱 → SNP 호출 및 데이터 품질 검증(call rate ≥ 95 %, 정확도 ≥ 99 %)
• 제공 물품·소프트웨어
  • 분석에 필요한 시약·키트(DNA 추출, 라이브러리, 시퀀싱) 및 소모품
  • 데이터 처리 파이프라인(FastQC, Trimmomatic, BWA, GATK 등) 및 보고서 자동화 툴(R / Python 기반)
  • 최종 산출물: VCF 파일(SNP 데이터), FASTQ 파일(원시 시퀀스), 분석 요약 보고서(표/그래프 포함)
• 품질·성능 기준
  • 샘플당 평균 리드 깊이(≥ 10×) 및 전체 유전체 커버리지(≥ 80 %) 보장
  • 분석 결과는 표준 포맷(VCF v4.2)으로 제공, 필요 시 맞춤형 데이터베이스 연동 가능
• 납기·주기
  • 각 SET 2 분석 완료 후 7 일 이내 보고서 및 데이터 전달
  • 연간 계약량은 단가 기준(예: 1 샘플당 KRW X 원)으로 산정, 초과·부족 시 조정 불가

4. 주의사항

• 계약서·단가표 확인: 본 공고에 첨부된 “연간단가계약 품목명세서(6번)”에 명시된 **단가표(단위가격)**와 **수량(예: 6 건)**을 정확히 확인해야 한다. 단가 변경 시 계약 위반 위험이 있다.
• 샘플 관리: 샘플은 생물안전·품질 관리 절차대로 수령·보관·처리해야 하며, 샘플 손실·오염 시 책임 소재가 명확히 규정된다.
• 데이터 보안: 분석 결과는 국가 연구기관의 민감 데이터이므로 암호화·접근 제한을 반드시 적용하고, 최종 전달 시 NDA 체결이 필요하다.
• 품질 검증: 분석 단계에서 중간 품질 검토(QC) 결과를 제출해야 하며, 품질 미달 시 재작업·보상 요구가 발생할 수 있다.
• 계약 이행 평가: 연간 계약 종료 시 성과 평가(분석 정확도, 납기 준수, 보고서 품질 등)가 이루어지며, 평가 결과에 따라 차년도 계약 연장이 결정된다.
• 기술·규격 변동: 계약 체결 후 시퀀싱 플랫폼·시약 등 기술 사양이 변경될 경우, 사전 협의 없이 변경하면 계약 위반으로 간주될 수 있다.
• 제출 서류: 입찰서 외에 사업자등록증, 인증서, 최근 3년간 유사 계약 실적, 인력·설비 현황 등을 포함한 서류를 누락 없이 제출해야 한다.

요약: 본 공고는 2026 년 국립식량과학원 실험분석에 필요한 “밀 고밀도서열 96 샘플 SET 2” 분석 서비스를 연간 단가 계약으로 수행하는 입찰이며, 고밀도서열·시퀀싱·데이터 분석 전 과정을 일괄 제공할 수 있는 인증된 기업·기관이 대상이다. 계약 조건(단가·납기·품질·보안 등)을 정확히 파악하고, 해당 요건을 충족할 수 있는 기술·인력·인프라를 갖춘 업체가 참여해야 한다.